Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL16

CFAP45, Cilia- and flagella-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP45Q9UL16 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP45Q9UL16 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP45Q9UL16 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP45Q9UL16 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP45Q9UL16 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP45Q9UL16 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP45Q9UL16 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP45Q9UL16 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP45Q9UL16 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP45Q9UL16 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP45Q9UL16 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP45Q9UL16 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP45Q9UL16 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP45Q9UL16 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP45Q9UL16 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP45Q9UL16 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP45Q9UL16 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP45Q9UL16 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP45Q9UL16 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP45Q9UL16 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP45Q9UL16 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP45Q9UL16 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP45Q9UL16 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP45Q9UL16 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP45Q9UL16 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP45Q9UL16 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP45Q9UL16 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP45Q9UL16 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP45Q9UL16 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP45Q9UL16 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP45Q9UL16 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP45Q9UL16 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP45Q9UL16 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP45Q9UL16 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP45Q9UL16 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP45Q9UL16 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP45Q9UL16 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP45Q9UL16 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms