Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms