Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms