Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1Q9UJ41 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RABGEF1Q9UJ41 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RABGEF1Q9UJ41 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RABGEF1Q9UJ41 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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RABGEF1Q9UJ41 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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RABGEF1Q9UJ41 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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RABGEF1Q9UJ41 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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RABGEF1Q9UJ41 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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