Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms