Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MED13Q9UHV7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MED13Q9UHV7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MED13Q9UHV7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MED13Q9UHV7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MED13Q9UHV7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MED13Q9UHV7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED13Q9UHV7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MED13Q9UHV7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED13Q9UHV7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED13Q9UHV7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MED13Q9UHV7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED13Q9UHV7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MED13Q9UHV7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED13Q9UHV7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED13Q9UHV7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED13Q9UHV7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED13Q9UHV7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED13Q9UHV7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED13Q9UHV7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED13Q9UHV7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED13Q9UHV7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED13Q9UHV7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MED13Q9UHV7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED13Q9UHV7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MED13Q9UHV7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED13Q9UHV7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED13Q9UHV7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED13Q9UHV7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED13Q9UHV7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MED13Q9UHV7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED13Q9UHV7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MED13Q9UHV7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MED13Q9UHV7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED13Q9UHV7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MED13Q9UHV7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MED13Q9UHV7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MED13Q9UHV7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MED13Q9UHV7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED13Q9UHV7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms