Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH65

SWAP70, Switch-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWAP70Q9UH65 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SWAP70Q9UH65 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms