Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP3AQ9UFN0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms