Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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