Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms