Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms