Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA3Q9NZ52 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA3Q9NZ52 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA3Q9NZ52 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA3Q9NZ52 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA3Q9NZ52 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA3Q9NZ52 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA3Q9NZ52 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGA3Q9NZ52 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGA3Q9NZ52 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGA3Q9NZ52 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGA3Q9NZ52 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGA3Q9NZ52 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGA3Q9NZ52 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGA3Q9NZ52 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GGA3Q9NZ52 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGA3Q9NZ52 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGA3Q9NZ52 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGA3Q9NZ52 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGA3Q9NZ52 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGA3Q9NZ52 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGA3Q9NZ52 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGA3Q9NZ52 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGA3Q9NZ52 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms