Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms