Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms