Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED17Q9NVC6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms