Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms