Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
PDS5BQ9NTI5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms