Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TREX1Q9NSU2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TREX1Q9NSU2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TREX1Q9NSU2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TREX1Q9NSU2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TREX1Q9NSU2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TREX1Q9NSU2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TREX1Q9NSU2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TREX1Q9NSU2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TREX1Q9NSU2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TREX1Q9NSU2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TREX1Q9NSU2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TREX1Q9NSU2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TREX1Q9NSU2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TREX1Q9NSU2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TREX1Q9NSU2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TREX1Q9NSU2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TREX1Q9NSU2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TREX1Q9NSU2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TREX1Q9NSU2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TREX1Q9NSU2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms