Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms