Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms