Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELLSQ9NRZ9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms