Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TULP4Q9NRJ4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms