Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHST12Q9NRB3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHST12Q9NRB3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHST12Q9NRB3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHST12Q9NRB3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHST12Q9NRB3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHST12Q9NRB3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHST12Q9NRB3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHST12Q9NRB3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHST12Q9NRB3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CHST12Q9NRB3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms