Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR12

PDLIM7, PDZ and LIM domain protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM7Q9NR12 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDLIM7Q9NR12 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDLIM7Q9NR12 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms