Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms