Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms