Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms