Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms