Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLMPQ9H6B4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms