Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms