Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF39Q9H2S5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF39Q9H2S5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF39Q9H2S5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF39Q9H2S5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RNF39Q9H2S5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
RNF39Q9H2S5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RNF39Q9H2S5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RNF39Q9H2S5 AC007228.2-201ENST00000602145 1328 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 AC123767.1-204ENST00000523523 273 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 SPINK1-203ENST00000510027 1188 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 LYRM7-203ENST00000510516 604 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 AC007494.2-201ENST00000563757 764 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 MAPK10-379ENST00000642013 1385 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 EAF2-202ENST00000451944 960 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 AP003716.1-203ENST00000533670 613 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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