Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CEP44Q9C0F1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms