Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms