Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms