Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms