Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4AQ9BY43 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms