Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
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RAB11FIP5Q9BXF6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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RAB11FIP5Q9BXF6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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RAB11FIP5Q9BXF6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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RAB11FIP5Q9BXF6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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RAB11FIP5Q9BXF6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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RAB11FIP5Q9BXF6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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RAB11FIP5Q9BXF6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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