Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms