Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW11

MXD3, Max dimerization protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXD3Q9BW11 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MXD3Q9BW11 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MXD3Q9BW11 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MXD3Q9BW11 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MXD3Q9BW11 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MXD3Q9BW11 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MXD3Q9BW11 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MXD3Q9BW11 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MXD3Q9BW11 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MXD3Q9BW11 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MXD3Q9BW11 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MXD3Q9BW11 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MXD3Q9BW11 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MXD3Q9BW11 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms