Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAGR1Q9BTK6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAGR1Q9BTK6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAGR1Q9BTK6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAGR1Q9BTK6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAGR1Q9BTK6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAGR1Q9BTK6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAGR1Q9BTK6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PAGR1Q9BTK6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAGR1Q9BTK6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PAGR1Q9BTK6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAGR1Q9BTK6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAGR1Q9BTK6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAGR1Q9BTK6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAGR1Q9BTK6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAGR1Q9BTK6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAGR1Q9BTK6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAGR1Q9BTK6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAGR1Q9BTK6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAGR1Q9BTK6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAGR1Q9BTK6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAGR1Q9BTK6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAGR1Q9BTK6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAGR1Q9BTK6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PAGR1Q9BTK6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAGR1Q9BTK6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAGR1Q9BTK6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAGR1Q9BTK6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAGR1Q9BTK6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAGR1Q9BTK6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAGR1Q9BTK6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAGR1Q9BTK6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAGR1Q9BTK6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PAGR1Q9BTK6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAGR1Q9BTK6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAGR1Q9BTK6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAGR1Q9BTK6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAGR1Q9BTK6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms