Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms