Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms