Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LARP6Q9BRS8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms