Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP1Q9BPW8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms