Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms