Protein–RNA interactions for Protein: Q99742

NPAS1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1Q99742 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPAS1Q99742 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms