Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PIK3R4Q99570 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms