Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms