Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms