Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms